Rarefy includes functions for the calculation of spatially and non-spatially explicit rarefaction curves using different indices of taxonomic, functional and phylogenetic diversity. The user can also rarefy any biodiversity metric as provided by a self-written function (or an already existent one) that gives as output a vector with the values of a certain index of biodiversity calculated per plot (Ricotta, C., Acosta, A., Bacaro, G., Carboni, M., Chiarucci, A., Rocchini, D., Pavoine, S. (2019) ; Bacaro, G., Altobelli, A., Cameletti, M., Ciccarelli, D., Martellos, S., Palmer, M. W., . . . Chiarucci, A. (2016) ; Bacaro, G., Rocchini, D., Ghisla, A., Marcantonio, M., Neteler, M., & Chiarucci, A. (2012) )

Rarefy: Rarefaction Method

Enrico Tordoni;Giovanni Bacaro
2020-01-01

Abstract

Rarefy includes functions for the calculation of spatially and non-spatially explicit rarefaction curves using different indices of taxonomic, functional and phylogenetic diversity. The user can also rarefy any biodiversity metric as provided by a self-written function (or an already existent one) that gives as output a vector with the values of a certain index of biodiversity calculated per plot (Ricotta, C., Acosta, A., Bacaro, G., Carboni, M., Chiarucci, A., Rocchini, D., Pavoine, S. (2019) ; Bacaro, G., Altobelli, A., Cameletti, M., Ciccarelli, D., Martellos, S., Palmer, M. W., . . . Chiarucci, A. (2016) ; Bacaro, G., Rocchini, D., Ghisla, A., Marcantonio, M., Neteler, M., & Chiarucci, A. (2012) )
2020
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