Genome Analyses of &gt;200,000 Individuals Identify 58 Loci for Chronic Inflammation and Highlight Pathways that Link Inflammation and Complex Disorders

Ligthart, S.; Vaez, A.; Vosa, U.; Stathopoulou, M. G.; de Vries, P. S.; Prins, B. P.; Van der Most, P. J.; Tanaka, T.; Naderi, E.; Rose, L. M.; Wu, Y.; Karlsson, R.; Barbalic, M.; Lin, H.; Pool, R.; Zhu, G.; Mace, A.; Sidore, C.; Trompet, S.; Mangino, M.; Sabater-Lleal, M.; Kemp, J. P.; Abbasi, A.; Kacprowski, T.; Verweij, N.; Smith, A. V.; Huang, T.; Marzi, C.; Feitosa, M. F.; Lohman, K. K.; Kleber, M. E.; Milaneschi, Y.; Mueller, C.; Huq, M.; Vlachopoulou, E.; Lyytikainen, L. -P.; Oldmeadow, C.; Deelen, J.; Perola, M.; Zhao, J. H.; Feenstra, B.; Alizadeh, B. Z.; Boezen, H. M.; Franke, L.; van der Harst, P.; Navis, G.; Rots, M.; Snieder, H.; Swertz, M.; Wolffenbuttel, B. H. R.; Wijmenga, C.; Amini, M.; Benjamin, E.; Chasman, D. I.; Dehghan, A.; Ahluwalia, T. S.; Meigs, J.; Tracy, R.; Alizadeh, B. Z.; Ligthart, S.; Bis, J.; Eiriksdottir, G.; Pankratz, N.; Gross, M.; Rainer, A.; Snieder, H.; Wilson, J. G.; Psaty, B. M.; Dupuis, J.; Prins, B.; Vaso, U.; Stathopoulou, M.; Franke, L.; Lehtimaki, T.; Koenig, W.; Jamshidi, Y.; Siest, S.; Abbasi, A.; Uitterlinden, A. G.; Abdollahi, M.; Schnabel, R.; Schick, U. M.; Nolte, I. M.; Kraja, A.; Hsu, Y. -H.; Tylee, D. S.; Zwicker, A.; Uher, R.; Davey-Smith, G.; Morrison, A. C.; Hicks, A.; van Duijn, C. M.; Ward-Caviness, C.; Boerwinkle, E.; Rotter, J.; Rice, K.; Lange, L.; Perola, M.; de Geus, E.; Morris, A. P.; Makela, K. M.; Stacey, D.; Eriksson, J.; Frayling, T. M.; Slagboom, E. P.; Lahti, J.; Schraut, K. E.; Fornage, M.; Suktitipat, B.; Chen, W. -M.; Li, X.; Nutile, T.; Malerba, G.; Luan, J.; Bak, T.; Schork, N.; Del Greco, M. F.; Thiering, E.; Mahajan, A.; Marioni, R. E.; Mihailov, E.; Eriksson, J.; Ozel, A. B.; Zhang, W.; Nethander, M.; Cheng, Y. -C.; Aslibekyan, S.; Ang, W.; Gandin, I.; Yengo, L.; Portas, L.; Kooperberg, C.; Hofer, E.; Rajan, K. B.; Schurmann, C.; den Hollander, W.; Ahluwalia, T. S.; Zhao, J.; Draisma, H. H. M.; Ford, I.; Timpson, N.; Teumer, A.; Huang, H.; Wahl, S.; Liu, Y.; Huang, J.; H. -W., Uh; Geller, F.; Joshi, P. K.; Yanek, L. R.; Trabetti, E.; Lehne, B.; Vozzi, D.; Verbanck, M.; Biino, G.; Saba, Y.; Meulenbelt, I.; O'Connell, J. R.; Laakso, M.; Giulianini, F.; Magnusson, P. K. E.; Ballantyne, C. M.; Hottenga, J. J.; Montgomery, G. W.; Rivadineira, F.; Rueedi, R.; Steri, M.; Herzig, K. -H.; Stott, D. J.; Menni, C.; Franberg, M.; t. Pourcain B., S; Felix, S. B.; Pers, T. H.; Bakker, S. J. L.; Kraft, P.; Peters, A.; Vaidya, D.; Delgado, G.; Smit, J. H.; Grossmann, V.; Sinisalo, J.; Seppala, I.; Williams, S. R.; Holliday, E. G.; Moed, M.; Langenberg, C.; Raikkonen, K.; Ding, J.; Campbell, H.; Sale, M. M.; Chen, Y. -D. I.; James, A. L.; Ruggiero, D.; Soranzo, N.; Hartman, C. A.; Smith, E. N.; Berenson, G. S.; Fuchsberger, C.; Hernandez, D.; Tiesler, C. M. T.; Giedraitis, V.; Liewald, D.; Fischer, K.; Mellstrom, D.; Larsson, A.; Wang, Y.; Scott, W. R.; Lorentzon, M.; Beilby, J.; Ryan, K. A.; Pennell, C. E.; Vuckovic, D.; Balkau, B.; Concas, M. P.; Schmidt, R.; Mendes de Leon, C. F.; Bottinger, E. P.; Kloppenburg, M.; Paternoster, L.; Boehnke, M.; Musk, A. W.; Willemsen, G.; Evans, D. M.; Madden, P. A. F.; Kahonen, M.; Kutalik, Z.; Zoledziewska, M.; Karhunen, V.; Kritchevsky, S. B.; Sattar, N.; Lachance, G.; Clarke, R.; Harris, T. B.; Raitakari, O. T.; Attia, J. R.; van Heemst, D.; Kajantie, E.; Sorice, R.; Gambaro, G.; Scott, R. A.; Hicks, A. A.; Ferrucci, L.; Standl, M.; Lindgren, C. M.; Starr, J. M.; Karlsson, M.; Lind, L.; J. Z., Li; Chambers, J. C.; Mori, T. A.; de Geus, E. J. C. N.; Heath, A. C.; Martin, N. G.; Auvinen, J.; Buckley, B. M.; de Craen, A. J. M.; Waldenberger, M.; Strauch, K.; Meitinger, T.; Scott, R. J.; Mcevoy, M.; Beekman, M.; Bombieri, C.; Ridker, P. M.; Mohlke, K. L.; Pedersen, N. L.; Morrison, A. C.; Boomsma, D. I.; Whitfield, J. B.; Strachan, D. P.; Hofman, A.; Vollenweider, P.; Cucca, F.; Jarvelin, M. -R.; Jukema, J. W.; Spector, T. D.; Hamsten, A.; Zeller, T.; Uitterlinden, A. G.; Nauck, M.; Gudnason, V.; Qi, L.; Grallert, H.; Borecki, I. B.; Rotter, J. I.; Marz, W.; Wild, P. S.; Lokki, M. -L.; Boyle, M.; Salomaa, V.; Melbye, M.; Eriksson, J. G.; Wilson, J. F.; Penninx, B. W. J. H.; Becker, D. M.; Worrall, B. B.; Gibson, G.; Krauss, R. M.; Ciullo, M.; Zaza, G.; Wareham, N. J.; Oldehinkel, A. J.; Palmer, L. J.; Murray, S. S.; Pramstaller, P. P.; Bandinelli, S.; Heinrich, J.; Ingelsson, E.; Deary, I. J.; Magi, R.; Vandenput, L.; van der Harst, P.; Desch, K. C.; Kooner, J. S.; Ohlsson, C.; Hayward, C.; Lehtimaki, T.; Shuldiner, A. R.; Arnett, D. K.; Beilin, L. J.; Robino, A.; Froguel, P.; Pirastu, M.; Jess, T.; Loos, R. J. F.; Evans, D. A.; Schmidt, H.; Slagboom, P. E.; Eiriksdottir, G.; Morris, A. P.; Psaty, B. M.; Tracy, R. P.; Nolte, I. M.; Boerwinkle, E.; Visvikis-Siest, S.; Reiner, A. P.; Gross, M.; Bis, J. C.; Franke, L.; Franco, O. H.; Benjamin, E. J.; Chasman, D. I.; Dupuis, J.; Snieder, H.; Dehghan, A.; Alizadeh, B. Z.

doi:10.1016/j.ajhg.2018.09.009

C-reactive protein (CRP) is a sensitive biomarker of chronic low-grade inflammation and is associated with multiple complex diseases. The genetic determinants of chronic inflammation remain largely unknown, and the causal role of CRP in several clinical outcomes is debated. We performed two genome-wide association studies (GWASs), on HapMap and 1000 Genomes imputed data, of circulating amounts of CRP by using data from 88 studies comprising 204,402 European individuals. Additionally, we performed in silico functional analyses and Mendelian randomization analyses with several clinical outcomes. The GWAS meta-analyses of CRP revealed 58 distinct genetic loci (p < 5 × 10−8). After adjustment for body mass index in the regression analysis, the associations at all except three loci remained. The lead variants at the distinct loci explained up to 7.0% of the variance in circulating amounts of CRP. We identified 66 gene sets that were organized in two substantially correlated clusters, one mainly composed of immune pathways and the other characterized by metabolic pathways in the liver. Mendelian randomization analyses revealed a causal protective effect of CRP on schizophrenia and a risk-increasing effect on bipolar disorder. Our findings provide further insights into the biology of inflammation and could lead to interventions for treating inflammation and its clinical consequences.

Genome Analyses of >200,000 Individuals Identify 58 Loci for Chronic Inflammation and Highlight Pathways that Link Inflammation and Complex Disorders

Ligthart S.;Vaez A.;Vosa U.;Stathopoulou M. G.;de Vries P. S.;Prins B. P.;Van der Most P. J.;Tanaka T.;Naderi E.;Rose L. M.;Wu Y.;Karlsson R.;Barbalic M.;Lin H.;Pool R.;Zhu G.;Mace A.;Sidore C.;Trompet S.;Mangino M.;Sabater-Lleal M.;Kemp J. P.;Abbasi A.;Kacprowski T.;Verweij N.;Smith A. V.;Huang T.;Marzi C.;Feitosa M. F.;Lohman K. K.;Kleber M. E.;Milaneschi Y.;Mueller C.;Huq M.;Vlachopoulou E.;Lyytikainen L. -P.;Oldmeadow C.;Deelen J.;Perola M.;Zhao J. H.;Feenstra B.;Alizadeh B. Z.;Boezen H. M.;Franke L.;van der Harst P.;Navis G.;Rots M.;Snieder H.;Swertz M.;Wolffenbuttel B. H. R.;Wijmenga C.;Amini M.;Benjamin E.;Chasman D. I.;Dehghan A.;Ahluwalia T. S.;Meigs J.;Tracy R.;Alizadeh B. Z.;Ligthart S.;Bis J.;Eiriksdottir G.;Pankratz N.;Gross M.;Rainer A.;Snieder H.;Wilson J. G.;Psaty B. M.;Dupuis J.;Prins B.;Vaso U.;Stathopoulou M.;Franke L.;Lehtimaki T.;Koenig W.;Jamshidi Y.;Siest S.;Abbasi A.;Uitterlinden A. G.;Abdollahi M.;Schnabel R.;Schick U. M.;Nolte I. M.;Kraja A.;Hsu Y. -H.;Tylee D. S.;Zwicker A.;Uher R.;Davey-Smith G.;Morrison A. C.;Hicks A.;van Duijn C. M.;Ward-Caviness C.;Boerwinkle E.;Rotter J.;Rice K.;Lange L.;Perola M.;de Geus E.;Morris A. P.;Makela K. M.;Stacey D.;Eriksson J.;Frayling T. M.;Slagboom E. P.;Lahti J.;Schraut K. E.;Fornage M.;Suktitipat B.;Chen W. -M.;Li X.;Nutile T.;Malerba G.;Luan J.;Bak T.;Schork N.;Del Greco M. F.;Thiering E.;Mahajan A.;Marioni R. E.;Mihailov E.;Eriksson J.;Ozel A. B.;Zhang W.;Nethander M.;Cheng Y. -C.;Aslibekyan S.;Ang W.;Gandin I.;Yengo L.;Portas L.;Kooperberg C.;Hofer E.;Rajan K. B.;Schurmann C.;den Hollander W.;Ahluwalia T. S.;Zhao J.;Draisma H. H. M.;Ford I.;Timpson N.;Teumer A.;Huang H.;Wahl S.;Liu Y.;Huang J.;Uh H. -W.;Geller F.;Joshi P. K.;Yanek L. R.;Trabetti E.;Lehne B.;Vozzi D.;Verbanck M.;Biino G.;Saba Y.;Meulenbelt I.;O'Connell J. R.;Laakso M.;Giulianini F.;Magnusson P. K. E.;Ballantyne C. M.;Hottenga J. J.;Montgomery G. W.;Rivadineira F.;Rueedi R.;Steri M.;Herzig K. -H.;Stott D. J.;Menni C.;Franberg M.;St. Pourcain B.;Felix S. B.;Pers T. H.;Bakker S. J. L.;Kraft P.;Peters A.;Vaidya D.;Delgado G.;Smit J. H.;Grossmann V.;Sinisalo J.;Seppala I.;Williams S. R.;Holliday E. G.;Moed M.;Langenberg C.;Raikkonen K.;Ding J.;Campbell H.;Sale M. M.;Chen Y. -D. I.;James A. L.;Ruggiero D.;Soranzo N.;Hartman C. A.;Smith E. N.;Berenson G. S.;Fuchsberger C.;Hernandez D.;Tiesler C. M. T.;Giedraitis V.;Liewald D.;Fischer K.;Mellstrom D.;Larsson A.;Wang Y.;Scott W. R.;Lorentzon M.;Beilby J.;Ryan K. A.;Pennell C. E.;Vuckovic D.;Balkau B.;Concas M. P.;Schmidt R.;Mendes de Leon C. F.;Bottinger E. P.;Kloppenburg M.;Paternoster L.;Boehnke M.;Musk A. W.;Willemsen G.;Evans D. M.;Madden P. A. F.;Kahonen M.;Kutalik Z.;Zoledziewska M.;Karhunen V.;Kritchevsky S. B.;Sattar N.;Lachance G.;Clarke R.;Harris T. B.;Raitakari O. T.;Attia J. R.;van Heemst D.;Kajantie E.;Sorice R.;Gambaro G.;Scott R. A.;Hicks A. A.;Ferrucci L.;Standl M.;Lindgren C. M.;Starr J. M.;Karlsson M.;Lind L.;Li J. Z.;Chambers J. C.;Mori T. A.;de Geus E. J. C. N.;Heath A. C.;Martin N. G.;Auvinen J.;Buckley B. M.;de Craen A. J. M.;Waldenberger M.;Strauch K.;Meitinger T.;Scott R. J.;McEvoy M.;Beekman M.;Bombieri C.;Ridker P. M.;Mohlke K. L.;Pedersen N. L.;Morrison A. C.;Boomsma D. I.;Whitfield J. B.;Strachan D. P.;Hofman A.;Vollenweider P.;Cucca F.;Jarvelin M. -R.;Jukema J. W.;Spector T. D.;Hamsten A.;Zeller T.;Uitterlinden A. G.;Nauck M.;Gudnason V.;Qi L.;Grallert H.;Borecki I. B.;Rotter J. I.;Marz W.;Wild P. S.;Lokki M. -L.;Boyle M.;Salomaa V.;Melbye M.;Eriksson J. G.;Wilson J. F.;Penninx B. W. J. H.;Becker D. M.;Worrall B. B.;Gibson G.;Krauss R. M.;Ciullo M.;Zaza G.;Wareham N. J.;Oldehinkel A. J.;Palmer L. J.;Murray S. S.;Pramstaller P. P.;Bandinelli S.;Heinrich J.;Ingelsson E.;Deary I. J.;Magi R.;Vandenput L.;van der Harst P.;Desch K. C.;Kooner J. S.;Ohlsson C.;Hayward C.;Lehtimaki T.;Shuldiner A. R.;Arnett D. K.;Beilin L. J.;Robino A.;Froguel P.;Pirastu M.;Jess T.;Loos R. J. F.;Evans D. A.;Schmidt H.;Slagboom P. E.;Eiriksdottir G.;Morris A. P.;Psaty B. M.;Tracy R. P.;Nolte I. M.;Boerwinkle E.;Visvikis-Siest S.;Reiner A. P.;Gross M.;Bis J. C.;Franke L.;Franco O. H.;Benjamin E. J.;Chasman D. I.;Dupuis J.;Snieder H.;Dehghan A.;Alizadeh B. Z.

2018-01-01

Abstract

Scheda breve

Scheda completa

	Anno
	
				2018
			
	Stato di pubblicazione
	
				Pubblicato
			
	Rivista
	
				AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS
			
	DOI
	
				https://dx.doi.org/10.1016/j.ajhg.2018.09.009
			
	URL
	
				https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929718303203?via=ihub#!
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6218410/
			
	Appare nelle tipologie:
	
				1.1 Articolo in Rivista

File in questo prodotto:

File	Dimensione	Formato
2018_lighart.pdf Accesso chiuso Tipologia: Documento in Versione Editoriale Licenza: Digital Rights Management non definito Dimensione 2.39 MB Formato Adobe PDF Visualizza/Apri Richiedi una copia	2.39 MB	Adobe PDF	Visualizza/Apri Richiedi una copia
1-s2.0-S0002929718303203-mmc1.pdf Accesso chiuso Descrizione: Supplementary data Tipologia: Altro materiale allegato Licenza: Digital Rights Management non definito Dimensione 15.51 MB Formato Adobe PDF Visualizza/Apri Richiedi una copia	15.51 MB	Adobe PDF	Visualizza/Apri Richiedi una copia
1-s2.0-S0002929718303203-mmc2.pdf Accesso chiuso Descrizione: Supplementary data Tipologia: Altro materiale allegato Licenza: Digital Rights Management non definito Dimensione 1.67 MB Formato Adobe PDF Visualizza/Apri Richiedi una copia	1.67 MB	Adobe PDF	Visualizza/Apri Richiedi una copia
1-s2.0-S0002929718303203-mmc3.pdf Accesso chiuso Descrizione: Supplementary data Tipologia: Altro materiale allegato Licenza: Digital Rights Management non definito Dimensione 17.91 MB Formato Adobe PDF Visualizza/Apri Richiedi una copia	17.91 MB	Adobe PDF	Visualizza/Apri Richiedi una copia
3005048_2018_lighart-Post_print.pdf Accesso chiuso Tipologia: Bozza finale post-referaggio (post-print) Licenza: Creative commons Dimensione 2.84 MB Formato Adobe PDF Visualizza/Apri Richiedi una copia	2.84 MB	Adobe PDF	Visualizza/Apri Richiedi una copia

Pubblicazioni consigliate

I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.

Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11368/3005048

ArTS Archivio della ricerca di Trieste

Genome Analyses of >200,000 Individuals Identify 58 Loci for Chronic Inflammation and Highlight Pathways that Link Inflammation and Complex Disorders

2018-01-01

Abstract

Scheda breve

Scheda completa

Pubblicazioni consigliate

Citazioni

social impact

ArTS Archivio della ricerca di Trieste

Genome Analyses of >200,000 Individuals Identify 58 Loci for Chronic Inflammation and Highlight Pathways that Link Inflammation and Complex Disorders

2018-01-01

Abstract

Scheda breve Scheda completa

Pubblicazioni consigliate

Informazioni

Citazioni

social impact

Conferma cancellazione

Scheda breve

Scheda completa